深圳港拥有港口主要有:蛇口码头、福永码头、盐田码头、赤湾码头、妈湾码头、内河码、东角头码头、下桐沙渔涌码头、大铲湾码头。
2011年底,深圳港共拥有各类泊位172个,其中万吨级以上泊位69个,集装箱专用泊位45个,港口综合吞吐能力约2亿吨,集装箱吞吐能力1925万标准箱。有47家国际班轮公司在深圳港开辟集装箱国际班轮航线238条,是中国国际班轮航线密度最高的城市之一。深圳港集装箱吞吐量连续九年位居世界集装箱港口第四位。截止2021年末深圳市港口货物吞吐量27837.84万吨,比上年增长5.0%;集装箱吞吐量2876.76万标箱,增长8.4%,其中,出口集装箱吞吐量1456.29万标箱,增长7.1%。全市年末拥有港口泊位数164个,其中万吨级泊位75个。